西藏林芝市被譽(yù)為“雪域江南”,是生物多樣性熱點(diǎn)和生態(tài)研究寶庫,擁有全球罕見的高原峽谷、原始森林及垂直氣候帶,為冰川、動植物適應(yīng)性研究提供天然實驗室。其獨(dú)特的門巴、珞巴民族文化與雅魯藏布大峽谷等世界級景觀深度融合,科學(xué)考察與生態(tài)旅游協(xié)同發(fā)展?jié)摿薮?#xff0c;是科研與旅行者探秘的終極目的地。
近年來,廣東省醫(yī)療援藏專家、廣東省人民醫(yī)院急診科李欣教授團(tuán)隊攜手上海百趣代謝組學(xué)技術(shù)研究中心等多家單位,圍繞中等海拔暴露對人體代謝的影響展開了持續(xù)深入的系列探索。
首先揭示,中等海拔暴露(以西藏林芝2900米為例)可通過調(diào)控腸道菌群與血清代謝組影響人體空腹血糖等指標(biāo),為胰島素抵抗相關(guān)代謝綜合征的防治提供了新方向,相關(guān)成果發(fā)表于Science of The Total Environment (深度合作文章 | 去“西藏江南”旅游可以“減重降糖”?多方合作報道帶你深度解析)。
在此基礎(chǔ)上,進(jìn)一步在國際著名期刊Redox Biology發(fā)現(xiàn),中等海拔暴露會引起血清尿酸及代謝組的動態(tài)變化,其中β-丙氨酸與尿酸水平呈顯著負(fù)相關(guān),干預(yù)實驗證實其可改善高尿酸血癥;同時,基于血清代謝物和臨床指標(biāo)構(gòu)建的預(yù)測模型,能輔助識別暴露期間無癥狀高尿酸血癥風(fēng)險(合作發(fā)文|廣東省醫(yī)療援藏首席專家李欣攜手上海百趣探究如何用“氨基酸魔法”擊敗“高尿酸魔法”?)。
最新研究中,在Virulence發(fā)表的成果將探索推向更深層,首次系統(tǒng)解析了腸道多界微生態(tài)(包括細(xì)菌、真菌、古菌、噬菌體)在中等海拔暴露中的變化規(guī)律,發(fā)現(xiàn)其與血糖、短鏈脂肪酸代謝密切關(guān)聯(lián),為通過調(diào)控腸道微生態(tài)改善代謝疾病提供了更全面的科學(xué)支撐。從腸道菌群與血糖調(diào)控的初探,到尿酸代謝及干預(yù)策略的揭示,再到腸道多界微生態(tài)的深度解析,這一系列研究層層遞進(jìn),逐步揭開了中等海拔環(huán)境與人體代謝健康的復(fù)雜關(guān)聯(lián),為相關(guān)疾病的預(yù)防和治療開辟了獨(dú)特路徑。
廣東省醫(yī)療援藏專家、廣東省人民醫(yī)院李欣教授和上海百趣代謝組學(xué)技術(shù)研究中心劉志鵬研究員為共同通訊作者;廣東省人民醫(yī)院黃筱然博士、高小燕博士以及上海百趣代謝組學(xué)技術(shù)研究中心范艷群助理研究員為論文共同第一作者。
背景介紹
高原環(huán)境以低壓、低氧、低溫和強(qiáng)紫外線為特征,機(jī)體為適應(yīng)高原環(huán)境會引發(fā)心率加快、紅細(xì)胞增多等適應(yīng)性生理反應(yīng)。但有研究表明,間歇性低氧暴露或短期高原暴露(3~21天)能改善空腹血糖(Fasting Blood Glucose, FBG)水平、體重和心肺功能。因此,研究高海拔暴露對人體健康影響的確切作用和潛在機(jī)制顯得尤為重要。
近年來,腸道微生態(tài)(包括細(xì)菌、真菌、古菌和病毒等)在人類健康中的研究備受關(guān)注,如腸道菌群失調(diào)被報道與心血管疾病、肥胖癥和二型糖尿病等疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。先前大部分腸道微生態(tài)的研究主要集中在細(xì)菌組,最近真菌組、古菌組和病毒組在人體健康方面的作用逐漸被認(rèn)知,它們可以通過與宿主機(jī)體互作從而發(fā)揮對健康的影響,如腸道酵母菌的富集可能促進(jìn)產(chǎn)短鏈脂肪酸菌的增加從而提高短鏈脂肪酸(Short-Chain Fatty Acids, SCFAs)含量;古菌產(chǎn)甲烷菌能與細(xì)菌協(xié)同作用,增強(qiáng)SCFAs的產(chǎn)生從而抑制癌癥的發(fā)展;腸道噬菌體的失調(diào)與代謝綜合征、胰島抵抗和肥胖的發(fā)生發(fā)展等相關(guān);此外,對心臟代謝性疾病患者進(jìn)行腸道病毒移植(Fecal Virome Transplantation, FVT)能改善患者的健康狀態(tài)。
最近人體腸道多界微生態(tài)的研究報道拓寬了人類對腸道微生態(tài)的認(rèn)知,如腸道細(xì)菌組、真菌組、古菌組和噬菌體組與地理位置、城市化、民族和飲食的研究,發(fā)現(xiàn)地理位置對腸道古菌組和噬菌體組的影響最大,城市化對腸道細(xì)菌組和真菌組的影響最大;而結(jié)直腸癌、肝硬化門診患者失代償和COVID-19結(jié)局的腸道多界微生態(tài)的研究報道增強(qiáng)了我們對這些疾病的病理生理機(jī)制和微生物相互作用的理解;此外,基于腸道多界微生態(tài)的疾病診斷模型可以完善或者增強(qiáng)疾病診斷預(yù)測能力,并為預(yù)防疾病進(jìn)展提供新的治療靶點(diǎn)。目前已有研究發(fā)現(xiàn)中短期(1天~12個月)的高海拔或中等海拔暴露可通過影響腸道細(xì)菌組來調(diào)控人或動物宿主表型,但目前國際上缺少長期≥12個月的中等海拔暴露如何影響腸道多界微生態(tài)及其功能進(jìn)而影響宿主健康的相關(guān)研究。
為了填補(bǔ)這個知識空白,我們探究了長期的中等海拔暴露對人體腸道多界微生態(tài)、血清代謝組和表型間的關(guān)系。通過募集來自廣州(平均海拔≤50m)的47個健康漢族人,并在他們作為志愿者進(jìn)入西藏林芝市(平均海拔=2,900m)居住后隨訪跟蹤了12個月;此外,也募集了47名在林芝市居住五年以上的健康志愿者(漢族:藏族=36:11)嘗試探索民族因素與中等海拔暴露時間長短對人體腸道多界微生態(tài)、血清代謝組和臨床表型的影響。本研究通過聯(lián)合糞便宏基因組技術(shù)和血清靶標(biāo)代謝組學(xué)技術(shù)(如氨基酸、中長鏈脂肪酸和膽汁酸)探索了中等海拔暴露對腸道多界微生態(tài)的組成和功能、噬菌體-細(xì)菌宿主互作、以及界內(nèi)和界間微生態(tài)的相互作用網(wǎng)絡(luò)的影響,此外通過結(jié)合多種統(tǒng)計分析方法探究了腸道多界微生態(tài)與血清代謝物及臨床表型間的相互作用,為通過調(diào)節(jié)腸道多界微生態(tài)進(jìn)而改善人體代謝提供科學(xué)依據(jù)。
研究結(jié)果
1、中等海拔暴露對健康漢族志愿者的表型組的影響
對中等海拔暴露前后健康漢族志愿者的19項臨床指標(biāo)進(jìn)行單變量統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn),2個臨床指標(biāo)(舒張壓和心率)在中等海拔暴露12個月后顯著升高,9個臨床指標(biāo)(如BMI、體重、FBG、胰島素等)顯著降低。對臨床指標(biāo)進(jìn)行線性混合效應(yīng)模型分析發(fā)現(xiàn),兩項增加的臨床指標(biāo)(舒張壓、心率)和六項減少的臨床指標(biāo)(如FBG、胰島素等)發(fā)生了顯著性變化。重要的是,盡管上述臨床指標(biāo)在中等海拔暴露人群中出現(xiàn)顯著性變化,但這些變化都在正常健康范圍內(nèi)。此外,飲食問卷調(diào)查結(jié)果表明中等海拔暴露人群的飲食營養(yǎng)攝入在暴露前后無顯著變化,而體力活動問卷結(jié)果表明中等海拔暴露后人群的運(yùn)動強(qiáng)度和頻率都有所下降。眾所周知,高強(qiáng)度的體育活動可能有助于改善代謝健康和降低血糖。這些結(jié)果綜合表明,體重、BMI和FBG的變化更可能由中等海拔暴露引起,飲食或體力活動的改變對上述臨床指標(biāo)的影響有限。
2、中等海拔暴露對健康人體腸道細(xì)菌組成的影響
首先,通過宏基因組測序分析了中等海拔暴露前后人體腸道細(xì)菌組成的變化(圖1A)。結(jié)果顯示,與中等海拔暴露前相比,中等海拔暴露12個月后(12M組)的人體的腸道細(xì)菌的α多樣性無顯著變化,門和種水平的β多樣性無顯著變化,但屬水平上β多樣性顯著降低(圖1B-C)。主坐標(biāo)分析(Principal Coordinates Analysis, PCoA)表明,中等海拔暴露前后,人體的腸道細(xì)菌在門、屬和種水平的組成上均發(fā)生顯著變化(圖1D)。對不同水平的腸道細(xì)菌進(jìn)行差異分析,與中等海拔暴露前相比,12M組的2個門(Candidatus Saccharibacteria和Proteobacteria)的相對豐度下降,而1個門(Bacteroidetes)的相對豐度上升;5個屬(如Agathobaculum、Romboutsia)的相對豐度下降,3個屬(如Prevotella、Phascolarctobacterium)的相對豐度上升;4個物種(如Agathobaculum butyriciproducens、Romboutsia timonensis)的相對豐度下降(圖2A)。此外,長期居住在林芝(>5年)的漢族(Local_H組)和藏族(Local_Z組)人群的細(xì)菌α多樣性無顯著差異,但Local_Z組在門、屬和種水平上的β多樣性均低于漢組且與中等海拔暴露時間無關(guān)(圖1B-C)。PCoA進(jìn)一步顯示,中等海拔暴露后人體的腸道細(xì)菌組成逐漸趨近于長期林芝居民(圖1D)。
圖1. 研究設(shè)計及中等海拔暴露后健康人群腸道多界微生態(tài)組成的變化
3、中等海拔暴露對健康人體腸道真菌組成的影響
然后,我們對中等海拔暴露對人體腸道真菌組成的影響進(jìn)行了評估,發(fā)現(xiàn)12M組中真菌α多樣性略有增加,屬水平上的β多樣性顯著降低,但門和種水平上的β多樣性無顯著差異(圖1B-C)。PCoA顯示,中等海拔暴露前后人體腸道真菌組成在屬和種水平上發(fā)生顯著變化,而在門水平上無顯著差異(圖1D)。對不同水平的腸道真菌進(jìn)行差異分析,與中等海拔暴露前相比,12M組中1個門(Chytridiomycota)的相對豐度增加,4個屬(如Cercospora、Kluyveromyces)和5個物種(如Cercospora beticola、Ogataea parapolymorpha)的相對豐度顯著上升(圖2B)。此外,Local_H組中真菌α多樣性顯著高于0M組,且在門、屬和種水平上的β多樣性均低于12M組(圖1B-C)。PCoA進(jìn)一步表明,中等海拔暴露人體的腸道真菌組成逐漸趨近于長期林芝居民(圖1D)。
4、中等海拔暴露對健康人體腸道古菌組成的影響
接著,我們還探討了中等海拔暴露對人體腸道古菌組成的影響。12M組中古菌α多樣性無顯著變化,但門水平上的β多樣性顯著升高,而屬和種水平上的β多樣性降低(圖1B-C)。PCoA顯示,暴露前后人體腸道古菌組成在門水平上的發(fā)生顯著變化,而在屬和種水平上無顯著差異(圖1D)。對不同水平的腸道古菌進(jìn)行差異分析,與中等海拔暴露前相比,12M組中2個門(Thaumarchaeota和Candidatus Thermoplasmatota)的相對豐度下降,而2個門(Crenarchaeota和Candidatus Lokiarchaeota)的相對豐度上升;3個屬(如Cuniculiplasma、Candidatus Nitrosopelagicus)的相對豐度下降,1個屬(Caldivirga)的相對豐度上升;4個物種(如Cuniculiplasma divulgatum和Candidatus Nitrosopelagicus brevis等)的相對豐度下降,1個物種(Caldivirga maquilingensis)的相對豐度上升(圖2C)。此外,Local_H組和Local_Z組人體的腸道古菌α多樣性呈現(xiàn)非顯著升高趨勢,但β多樣性顯著低于12M組,且Local_Z組的β多樣性最低(圖1B-C)。PCoA表明,中等海拔暴露人體的腸道古菌組成逐漸趨近于長期林芝居民(圖1D)。
5、中等海拔暴露對健康人體腸道噬菌體組成的影響
最后,我們評估了中等海拔暴露對腸道噬菌體組成的影響。與基線數(shù)據(jù)相比,12M組中噬菌體α多樣性無顯著變化,但門和種水平上的β多樣性顯著降低,屬水平上無差異(圖1B-C)。PCoA顯示暴露前后個體在門、屬和種水平上的噬菌體組成均發(fā)生顯著變化(圖1D)。對不同水平的腸道噬菌體進(jìn)行差異分析,與中等海拔暴露前相比,12M組中1個門(Uroviricota)的相對豐度下降,而2個門(Nucleocytoviricota和Kitrinoviricota)的相對豐度上升;1個屬(Beejeyvirus)的相對豐度下降,10個屬(如Pandoravirus和Shirahamavirus等)的相對豐度上升;10個物種(如Lactococcus phage bIL309和Beejeyvirus BJ1等)的相對豐度下降,8個物種(如Cebadecemvirus phi10una和Shirahamavirus PTm1等)的相對豐度上升(圖2D)。此外,Local_H組和Local_Z組人群的噬菌體α多樣性無顯著差異,但Local_H組在門和屬水平上的β多樣性顯著高于12M組,而Local_Z組在屬和種水平上的β多樣性顯著低于12M組,且Local_Z組的β多樣性在門、屬、種水平上都低于Local_H組(圖1B-C)。PCoA表明,中等海拔暴露人體的腸道噬菌體組成逐漸趨近于長期林芝居民(圖1D)。
圖2. 中等海拔暴露對健康人群的腸道各界微生物的影響
6、中等海拔暴露對健康人體腸道微生態(tài)功能的影響
為了探討中等海拔暴露對健康人體腸道微生態(tài)功能的影響,我們通過使用HUMAnN 3工具對腸道微生物組數(shù)據(jù)進(jìn)行功能分析。結(jié)果顯示,與中等海拔暴露前相比,12M組中有15條MetaCyc代謝通路顯著上調(diào),其中排名前5的MetaCyc代謝通路(如dTDP-&beta、L-rhamnose biosynthesis、xyloglucan degradation II (exoglucanase)等)主要由擬桿菌門物種(如Bacteroides vulgatus)和短鏈脂肪酸產(chǎn)生菌(如Faecalibacterium prausnitzii)驅(qū)動;此外,還發(fā)現(xiàn)有13條MetaCyc代謝通路在12M組中顯著下調(diào),排名前5的MetaCyc代謝通路(如ppGpp metabolism、superpathway of tetrahydrofolate biosynthesis等)主要由變形菌門物種(如Escherichia coli和Klebsiella pneumoniae)驅(qū)動。PCoA表明,中等海拔暴露人體的腸道微生態(tài)功能逐漸趨近于長期林芝居民(>5年)。
7. 中等海拔暴露對健康漢族人體腸道多界微生態(tài)相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)互作的影響
為了探討中等海拔暴露對健康漢族人體中腸道多界微生態(tài)(如細(xì)菌、真菌、古菌和噬菌體)的界內(nèi)和界間相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)作用的影響,我們對在50%以上樣本中出現(xiàn)的微生物進(jìn)行斯皮爾曼相關(guān)性分析。結(jié)果表明,中等海拔暴露前人體的腸道微生態(tài)的界內(nèi)相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)(由340個物種組成649個關(guān)聯(lián))比中等海拔暴露12個月(由229個物種組成402個關(guān)聯(lián))或5年以上(由212個物種組成303個關(guān)聯(lián))人體中的更為復(fù)雜(圖3A);其中古菌組和噬菌體組內(nèi)的相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)獨(dú)立于中等海拔暴露因素,呈現(xiàn)出比細(xì)菌組和真菌組內(nèi)的相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)更密集。此外,中等海拔暴露前人體的腸道微生態(tài)的界間相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)(由286個物種組成449個關(guān)聯(lián))也比中等海拔暴露12個月(由239個物種組成219個關(guān)聯(lián))或5年以上(由207個物種組成218個關(guān)聯(lián))人體中的更為復(fù)雜(圖3B);其中細(xì)菌組與噬菌體組之間的顯著性相互作用最多且最顯著。此外,我們還發(fā)現(xiàn)腸道多界微生態(tài)的界內(nèi)和界間微生物的顯著相互作用中正相關(guān)性數(shù)量遠(yuǎn)多于負(fù)相關(guān)性。
圖3. 中等海拔暴露對健康漢族人群的腸道多界微生態(tài)的相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)的影響
8、基于CRISPR spacer序列和MVP數(shù)據(jù)庫的噬菌體-細(xì)菌宿主分析
為闡明腸道噬菌體與細(xì)菌宿主的相互作用,我們分析了來自所有樣本的細(xì)菌contigs的CRISPR位點(diǎn),并結(jié)合了MVP數(shù)據(jù)庫比對的結(jié)果。結(jié)果顯示,在腸道噬菌體的科、屬和種水平上分別鑒定出129、448和579個獨(dú)特的噬菌體-細(xì)菌宿主相互作用(圖4A),且這些互作主要分為三類:噬菌體-擬桿菌門物種(如Bacteroides ovatus和Bacteroides uniformis等)、噬菌體-變形菌門物種(如Escherichia coli)以及噬菌體-短鏈脂肪酸產(chǎn)生菌(如Butyricicoccus和Ruminococcus等)。這些結(jié)果表明,中等海拔暴露可能會導(dǎo)致人體內(nèi)的SCFAs水平變化。隨后,我們對血清樣本進(jìn)行SCFAs檢測,結(jié)果顯示12M組中有5種SCFAs(如乙酸、丙酸和丁酸等)水平下降,異丁酸水平上升,己酸無變化(圖4B);隨著中等海拔暴露時間的延長,丁酸和戊酸水平出現(xiàn)了上升,而異丁酸水平出現(xiàn)了下降。這些結(jié)果表明,腸道多界微生態(tài)的組成、功能及相互作用的變化與中等海拔暴露人體內(nèi)血清SCFAs水平的改變密切相關(guān)。
圖4. 中等海拔暴露后健康人群的噬菌體-細(xì)菌宿主互作分析及血清SCFAs的變化
9、細(xì)菌-真菌-古菌-噬菌體-代謝物-臨床表型之間的關(guān)聯(lián)分析
為進(jìn)一步闡述健康人群的腸道多界微生態(tài)、血清代謝物與臨床表型間的潛在關(guān)系,我們使用上述篩選出來的差異指標(biāo)進(jìn)行rdcv-PLS模型分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)暴露前后的血清代謝物、臨床指標(biāo)和微生物數(shù)據(jù)在第一主成分上能明顯區(qū)分,且AAs與其他數(shù)據(jù)集間有較強(qiáng)的相關(guān)性;但真菌組與血清代謝物和臨床表型弱相關(guān),與其他微生物組數(shù)據(jù)中等相關(guān)。此外,rdcv-PLS模型篩選出63個關(guān)鍵變量,以|r|>0.6進(jìn)一步卡值后篩選出42個關(guān)鍵變量,其中FBG是唯一被rdcv-PLS模型選中的臨床指標(biāo)。而與FBG顯著相關(guān)的變量中,4種古菌、4種氨基酸、2種脂肪酸和2種膽汁酸與FBG正相關(guān);2種細(xì)菌、2種真菌、1種古菌和8種噬菌體與FBG負(fù)相關(guān)(圖5A-C)。PERMANOVA分析顯示,FBG水平對中鏈脂肪酸、氨基酸、噬菌體組和細(xì)菌組的影響顯著,且9個關(guān)鍵變量(如s_Shirahamavirus_PTm1、p_Crenarchaeota、p_Bacteroidetes等)對FBG水平的影響尤為突出(圖5D-E)。多變量邏輯回歸分析對這9個關(guān)鍵變量進(jìn)一步評估表明,s_Shirahamavirus_PTm1、p_Crenarchaeota和p_Bacteroidetes與FBG降低顯著正相關(guān),而s_Candidatus_Nitrosopelagicus_brevis和丁酸與FBG降低顯著負(fù)相關(guān)(圖5F)。這些發(fā)現(xiàn)揭示了腸道細(xì)菌、真菌、古菌、噬菌體與血清代謝物之間的相互作用可能影響中等海拔暴露人體的FBG水平,為糖尿病預(yù)防提供了潛在干預(yù)靶點(diǎn)。
圖5. 中等海拔暴露下健康人群的腸道細(xì)菌-真菌-古菌-噬菌體-代謝組-臨床表型間的互作
研究結(jié)論
本文揭示了中等海拔暴露與腸道多界微生態(tài)、血清代謝組和宿主表型之間的復(fù)雜相互作用,發(fā)現(xiàn)了中等海拔暴露導(dǎo)致腸道多界微生態(tài)及其功能的顯著變化,且這些變化與血清代謝組變化及FBG降低顯著相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)提示我們,使用來自中等海拔暴露過的健康人群的糞便,對血糖異常的人群施行FMT(糞菌移植)或FVT(糞病毒移植),或可能改善血糖穩(wěn)態(tài),且為預(yù)防和治療血糖異常及相關(guān)代謝疾病提供了新的研究方向。
通訊作者簡介
李欣,廣東省人民醫(yī)院,二級教授/主任醫(yī)師,博士,博士生導(dǎo)師?,F(xiàn)任廣東省人民醫(yī)院(廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院)副院長、黨委常委,急診科學(xué)術(shù)帶頭人、首席專家,中國-阿爾及利亞急診醫(yī)學(xué)聯(lián)合實驗室主任;華南理工大學(xué)醫(yī)學(xué)院學(xué)術(shù)委員會成員。兼任中國醫(yī)師協(xié)會急診分會常委;中國醫(yī)師協(xié)會急診分會質(zhì)控學(xué)組副主委;中國急診醫(yī)聯(lián)體副主席;廣東省醫(yī)學(xué)會理事會常務(wù)理事;廣東省醫(yī)師協(xié)會急診分會主委;廣東省醫(yī)學(xué)會急診分會常委,廣東省健康管理學(xué)會急診與災(zāi)難醫(yī)學(xué)分會副主委。2016年作為廣東省醫(yī)療人才組團(tuán)式援藏隊隊長,兼林芝市人民醫(yī)院院長,帶領(lǐng)西藏林芝市人民醫(yī)院以優(yōu)異的成績通過了三級甲等醫(yī)院的評審。2017年獲評國家衛(wèi)生計生突出貢獻(xiàn)中青年專家,2018年獲評廣東省醫(yī)學(xué)領(lǐng)軍人才暨杰出青年人才,2019年獲西藏自治區(qū)五一勞動獎?wù)隆?yōu)秀援藏干部稱號,是廣東省暨西藏自治區(qū)援藏首席專家?!吨腥A急診醫(yī)學(xué)雜志》編委、Resuscitation、American journal of emergency medicine審稿人。至今主持國家重點(diǎn)研發(fā)計劃項目和課題共3項、國家自然科學(xué)基金8項、省市級等課題10余項。主編學(xué)術(shù)專著8部。已發(fā)表第一作者或通訊作者SCI收錄論著100余篇,包括European heart journal、Allergy、Aging Cell、Journal of Nanobiotechnology、Critical Care Medicine、Stem Cells、Resuscitation等國際期刊。
劉志鵬,現(xiàn)任上海百趣代謝組學(xué)技術(shù)研究中心高級研究員,兼任國際學(xué)術(shù)雜志The Innovation、iMeta編委會成員,兼任Food Research International等雜志審稿人。主要從事腸道微生態(tài)、代謝組、蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組等組學(xué)與復(fù)雜疾病的跨組學(xué)關(guān)聯(lián)研究,挖掘“飲食干預(yù)或外部環(huán)境-腸道微生物-宿主代謝”之間關(guān)系在多種復(fù)雜疾病發(fā)生發(fā)展中起的作用,并嘗試疾病“預(yù)防、診斷、監(jiān)控、改善”的個體化醫(yī)療探索,致力于人體腸道微生態(tài)與臨床代謝組相關(guān)的科學(xué)研究和應(yīng)用轉(zhuǎn)化研究。參與完成多項國家自然基金、國家科技部973、載人航天工程等重大項目;已在Nature Medicine、Nature Communications、Gut、iMeta等雜志發(fā)表論文16篇,研究成果被Nature Reviews Endocrinology、Nature Reviews Cardiology等雜志評論。參編完成“十三五”規(guī)劃教材1部,參編完成學(xué)術(shù)專著1部,參與完成的“綠航星際”項目相關(guān)成果于2018年入選科普讀物:《飛舟日記-“太空180試驗”》、于2020年入選中國高中生教學(xué)教材:《2020-2021學(xué)年高一新教材地理必修第一冊》“第一章:宇宙中的地球”、于2023年入選中國國家博物館:逐夢寰宇問蒼穹—中國載人航天工程30年成就展。申請國際PCT專利5項,已獲授權(quán)國際PCT專利4項,已獲授權(quán)國內(nèi)專利2項,曾獲2項國際基因工程機(jī)械大賽IGEM金獎。
第一作者簡介
黃筱然,廣東省人民醫(yī)院急診科醫(yī)師,醫(yī)學(xué)博士,主要從事危重心血管疾病及腸道菌群方向的研究。參與多項國家自然科學(xué)基金與省自然科學(xué)基金,在Journal of nanobiotechnology,Science of the Total Environment,European Heart Journal等雜志發(fā)表論文16篇,其中第一作者/共同一作/共同通訊7篇。
高小燕,廣東省人民醫(yī)院急診科醫(yī)師,醫(yī)學(xué)博士。研究方向為主動脈夾層/主動脈瘤、腸道菌群與代謝性疾病及細(xì)胞衰老。參與國家自然科學(xué)基金、廣東自然基金面上項目各1項,在Aging cell、FASEB journal、Science of the Total Environment、中國病理生理雜志等國內(nèi)外期刊發(fā)表論文12篇,其中第一作者或共同一作5篇。
范艷群,現(xiàn)任上海百趣代謝組學(xué)技術(shù)研究中心研究員,擁有13年代謝組和多組學(xué)項目研究經(jīng)驗,目前主要從事腸道微生態(tài)、代謝組、蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組等多組學(xué)與復(fù)雜疾病的關(guān)聯(lián)研究以及算法開發(fā)和數(shù)據(jù)分析。參與完成多項國家自然基金、國家科技部863等重大項目;以共同作者身份在Science、Nature Communications、Food Research International、Science of the Total Environment等期刊發(fā)表論文12篇,其中發(fā)表在Science的酵母長染色體的精準(zhǔn)定制合成相關(guān)工作入選2017年度中國科學(xué)十大進(jìn)展,被Science、Nature、Nature Biotechnology、Nature Reviews Genetics和Molecular Cell等多家頂尖期刊評論;已獲授權(quán)國際PCT專利1項,已獲授權(quán)國內(nèi)專利6項,參編完成“十三五”規(guī)劃教材1部。
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